虽然是溯水而上，但东海舰队船只速度并不慢，之所以迟迟未到，是因为被镇巢军的突发事件牵制住了。镇巢军原本叫巢州，其位于长江北岸的巢湖，地处建康府和庐州中间，扼控淮西前往长江的水道，地理位置十分重要。伯颜率军攻宋时，驻守镇巢军的为夏贵家僮出身的洪福。夏贵降元后，洪福也被迫降元。元军为牢牢掌控巢州，便派来一支精锐阿速骑兵前来戍守。这些蓝眼回回兵十分残暴，入城之后大肆劫掠玉帛和女子，就连洪福及手下士卒的妻女也遭了殃。
洪福也极有血性，见阿速军如此残暴不仁，决心反叛。巢州的阿速军为两个千人队，士兵不仅身体高大，刀甲也十分精良，又是冲击力强的骑兵，正面交战的话，绝非是洪福的三千人所能抗衡的。洪福决定智取，他便一面派人前去联系霹雳军，一面派人送酒送肉，假意犒劳阿速军，并在酒中掺入了蒙汗药。阿速军士兵见有美酒，那里忍得住？痛饮之后皆昏睡过去，被洪福带着士卒逐一割了头颅。夏贵听闻镇巢之变大惊失色，急派侄儿前往劝降，却被洪福斩首。对于镇巢降而复叛，元军自然十分震怒，淮西元军昂吉儿部、炮手军薛四家奴部大举围攻巢州。巢州军民心知元军必然疯狂报复故拼死抵抗，竟然守住了城池。
死伤惨重之下，元军于是派夏贵亲自到城下招降。夏贵好言诱骗洪福，说自己愿“单骑入城”显示诚意，与洪福商谈降顺事宜。对于前主人洪福十分信任，正欲打开城门却被夏大根派来的联络军官劝阻了。联络官眼尖，早就发现了埋伏在城门附近的夏贵伏兵，只要城门打开他们就冲进城内。侥幸逃过一劫的洪福再也顾不得主仆情谊，先是破口大骂后又命人放箭。夏贵见计谋被戳破，只得狼狈而逃。夏大根先是派轻快战船前往巢湖驱离了围城的元军，又派了一个陆战营驻守巢州。在妥善处置完之后，才又挥师西进。
经历澉浦、焦山及江陵惨败的元军，对霹雳军已是深感恐惧。听闻东海舰队前来，沿途船只纷纷躲避，不少躲到了洞庭湖中。夏大根留了陆战队和战舰守住扼守洞庭湖与长江之处的江州，自己率主力径直往上游鄂州而去。元军当然不会放弃南北枢纽的鄂州，但也知水战不敌霹雳军，便让战船入汉水躲避，以图凭坚城利堡挡住东海舰队。他们将沿江城池人口粮草搬之一空，又在鄂州、阳逻堡等防御核心广筑土木工事。
见敌人拒不投降，夏大根也不多废话，直接下令炮击，摧毁敌人的火炮、投石机、弩炮之后继续前进。鄂州城防体系中，最坚固的堡垒莫过于阳逻堡，其壁立江中四面环水，元军在堡上设置了十余门火炮，还有数十门投石机弩炮，并筑了大量的土木工事。夏大根一眼便看出其防御弱点：面积太小又有不少树木，遂下令使用***攻击，给元军来了个烈火焚城。大火炙烤之下，堡中元军要么死于烟薰火燎之下，要么跳入江中逃命。阳逻堡一破，早已胆寒的鄂州元军也纷纷逃遁。
拿下鄂州后两日，东海舰队和第三军顺利会师。至此，长江航道被霹雳军彻底掌控。